八月二十六日，太子朱由校召见百官，宣布光宗皇帝驾崩的消息，同时与乾清宫中接受百官朝拜，继承大统。
紧接着，当天下午，京师城门关闭，全城大索，无数锦衣卫缇骑出动，开始抓人，文官、太监、勋贵、武将，都在他们抓捕范围之内。是日，京师萧条，百姓闭门不出，整个街上只有锦衣卫和羽林军轰隆隆的行军声。
羽林军除了两百骑兵留在身边护卫外，其他的都被朱由校派了出去，一千人在宫内搜捕清查，两千人出宫弹压各方卫所以及京营。至于剩下的一千名额，则是这次政变的伤亡人数了。
那晚的战斗，直接让羽林军减员四分之一，不过也正是这一晚上的直面生死，将其历练出来，成为一直铁军，敢于直面箭雨，能够顶着弓箭冲锋。任谁看了现在前后两者不同的状态，都会发出一声惊叹。
正是因为如此，孙承宗仅仅靠着两千的长矛兵，就威压住京城附近数十卫所和三大营——接掌军权，搜捕叛逆。当然，此时朱明正统之名深入人心，朝廷威严尚在也是重要的原因。
从二十六日到二十九日，三天之内，整个京师都处于风声鹤唳当中，街道上都是抓人的缇骑，直到三十日，这个风潮才淡下来，京师才开始恢复平静，各种店铺开始开门营业。当然，也有很多店铺关门的，这都是牵连到了这次政变当中。
这三天，朱由校没有搬到乾清宫去，而是依然住在了羽林军的驻地。当然，现在这里已经改成了医院，三四百号的伤病将这里给占据了。
一千的伤亡当中，死亡人数有六百多人，剩下的都是各种不同的创伤，被后来的锦衣卫收敛，送到了这里。人数不多，以前的营房完全够用。
在羽林军的驻地当中，一直有个一个太医和几个学徒，这是朱由校从建军开始时就弄过来的，一直到了现在，受到了朱由校整整五年的熏陶，那名姓
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